三岛位于游戏后期的主线剧情区域，需要通过特定流程解锁。玩家需先完成关东地区八个道馆挑战并击败四天王，之后在枯叶市码头使用船票乘船前往一岛。一岛是七岛链的起点，而三岛则需从一岛向南航行抵达，具体位置在五岛与四岛之间，是连接多个岛屿剧情的关键中转站。
三岛的主要功能是推进火箭队相关剧情并获取重要道具。登岛后需前往岛屿东部的火箭队仓库，击败内部成员以获取密码片段。该密码用于解锁五岛的记忆仓库，进而触发后续蓝宝石争夺战的核心任务。三岛地形以山地和森林为主，野生宝可梦等级较高，建议队伍平均等级达到50级以上再前往探索。
三岛西北角设有宝可梦中心与商店，是补给的重要据点。中心旁的小屋内可触发NPC对话，获取关于岛屿历史的背景信息。岛屿南部存在隐藏洞穴，需使用冲浪术进入，内部有特殊道具和稀有宝可梦分布。三岛没有设立道馆，但存在多个训练家对战点，击败后能获得较高经验值。
完成三岛主线后，玩家需返回一岛与研究员对话，开启前往四岛和五岛的权限。三岛作为承前启后的关键节点，其剧情直接关联到全国图鉴的解锁条件。若在探索过程中遇到卡比兽挡路，需先取得宝可梦笛子从紫苑镇触发唤醒事件。
三岛的隐藏要素包括每日刷新的特殊NPC和周期性出现的稀有宝可梦。岛屿中部岩壁处存在需要怪力术推动的巨石谜题，解开后可获得进化石类道具。建议在晴天时段探索森林区域，较高概率遭遇特定属性的宝可梦。完成七岛全部剧情后，三岛会新增对战设施，但需注意这与主线进程无直接关联。
